Hyppää sisältöön
    • Suomeksi
    • In English
Trepo
  • Suomeksi
  • In English
  • Kirjaudu
Näytä viite 
  •   Etusivu
  • Trepo
  • Opinnäytteet - ylempi korkeakoulututkinto
  • Näytä viite
  •   Etusivu
  • Trepo
  • Opinnäytteet - ylempi korkeakoulututkinto
  • Näytä viite
JavaScript is disabled for your browser. Some features of this site may not work without it.

Training based segmentation for tissue extraction in whole slide image

Lagos, Juan Pablo (2019)

 
Avaa tiedosto
Lagos.pdf (6.741Mt)
Lataukset: 



Lagos, Juan Pablo
2019

Information Technology
Informaatioteknologian ja viestinnän tiedekunta - Faculty of Information Technology and Communication Sciences
This publication is copyrighted. You may download, display and print it for Your own personal use. Commercial use is prohibited.
Hyväksymispäivämäärä
2019-05-20
Näytä kaikki kuvailutiedot
Julkaisun pysyvä osoite on
https://urn.fi/URN:NBN:fi:tty-201905101568
Tiivistelmä
Reducing the time and storage memory required for scanning whole slide images (WSIs) is crucial. In this thesis work we tested and assessed the performance of two popular neural network architectures, namely DeepLabV3+ and Unet. In addition to that, a desktop application used to annotate histopathology images was developed, such application ultimately provided the data needed in order to train the neural networks. Both DeepLabV3+ and Unet accurately separated the regions of interest out of the WSIs, however DeepLabV3+ outperformed Unet, striking a pixel wise accuracy of 96.3%, while Unet scored 94.7% in the same metric. Morover DeepLabV3+ also outscored Unet in the IoU metric with values of 0:446 and 0:398 respectively. We showed the effectiveness of using deep neural networks for the case of semantic segmentation in histopathology images, more specifically for extracting tissue areas from WSIs, and how this can be used to improve the performance of WSI scanners.
Kokoelmat
  • Opinnäytteet - ylempi korkeakoulututkinto [40600]
Kalevantie 5
PL 617
33014 Tampereen yliopisto
oa[@]tuni.fi | Tietosuoja | Saavutettavuusseloste
 

 

Selaa kokoelmaa

TekijätNimekkeetTiedekunta (2019 -)Tiedekunta (- 2018)Tutkinto-ohjelmat ja opintosuunnatAvainsanatJulkaisuajatKokoelmat

Omat tiedot

Kirjaudu sisäänRekisteröidy
Kalevantie 5
PL 617
33014 Tampereen yliopisto
oa[@]tuni.fi | Tietosuoja | Saavutettavuusseloste