Genome-wide association study on dimethylarginines reveals novel AGXT2 variants associated with heart rate variability but not with overall mortality
SEPPÄLÄ, ILKKA (2014)
Tässä tietueessa ei ole kokotekstiä saatavilla Treposta, ainoastaan metadata.
SEPPÄLÄ, ILKKA
2014
Lääketiede - Medicine
Lääketieteen yksikkö - School of Medicine
Hyväksymispäivämäärä
2014-01-22
Julkaisun pysyvä osoite on
https://urn.fi/URN:NBN:fi:uta-201401231058
https://urn.fi/URN:NBN:fi:uta-201401231058
Tiivistelmä
Tavoitteet:
Tämän tutkimuksen tarkoituksena oli tunnistaa uusia geneettisiä variantteja, jotka
assosioituvat verestä mitattujen asymmetrisen dimetyyliarginiinin (ADMA) ja symmetrisen
dimetyyliarginiinin (SDMA) pitoisuuksiin. Lisäksi tavoitteena oli selvittää ennustavatko uudet
geenivariantit sydän- ja verisuonitautikuolleisuutta.
Menetelmät ja tulokset:
Ajoimme genominlaajuiset assosiaatioanalyysit ADMA:lle ja SDMA:lle sekä näiden suhteelle. Toistimme tunnetun assosiaatiosignaalin DDAH1-geenin ympäristössä ADMA pitoisuuksiin (rs997251; P=1.4×10-40). Lisäksi tunnistimme kaksi aminohappoa vaihtavaa mutaatiota AGXT2 geenissä (rs37369; P=1.4×10-40 ja rs16899974; P=1.5×10-38) sekä yhden SLC25A45 geenissä (rs34400381; P=2.5×10-10), jotka assosioituivat SDMA pitoisuuksiin. Lisäksi tutkimme tarkemmin AGXT2 geenilokusta useampien itsenäisten assosiaatiosignaalien havaitsemiseksi. Kaksi itsenäisesti SDMA tasoihin vaikuttavaa AGXT2-geenin yhden emäksen polymorfiaa assosioituivat myös sykkeen vaihteluun nuorilla aikuisilla. Uuden aminohappoavaihtavan rs16899974 (V498L) yhden emäksen polymorfian SDMA tasoja alentava alleeli oli lisäksi yhteydessä korkeampaan spektraalisen sykevaihtelun LF/HF-komponenttiin Laseri-tutkimuksessa (P=0.00047). Mikään nyt löydetyistä geneettisistä varianteista ei assosioitunut kokonaiskuolleisuuteen tai sydän- ja verisuonitautikuolleisuuteen LURIC-aineistossa.
Johtopäätökset:
AGXT2:lla on tärkeä rooli SDMA:n metaboliassa ihmisillä. AGXT2:lla saattaa olla
lisäksi aikaisemmin tunnistamaton rooli sydämen toimintaa säätelevän autonomisen hermoston
toiminnassa.
Published in European Heart Journal (October 24, 2013)
http://dx.doi.org/10.1093/eurheartj/eht447
Tämän tutkimuksen tarkoituksena oli tunnistaa uusia geneettisiä variantteja, jotka
assosioituvat verestä mitattujen asymmetrisen dimetyyliarginiinin (ADMA) ja symmetrisen
dimetyyliarginiinin (SDMA) pitoisuuksiin. Lisäksi tavoitteena oli selvittää ennustavatko uudet
geenivariantit sydän- ja verisuonitautikuolleisuutta.
Menetelmät ja tulokset:
Ajoimme genominlaajuiset assosiaatioanalyysit ADMA:lle ja SDMA:lle sekä näiden suhteelle. Toistimme tunnetun assosiaatiosignaalin DDAH1-geenin ympäristössä ADMA pitoisuuksiin (rs997251; P=1.4×10-40). Lisäksi tunnistimme kaksi aminohappoa vaihtavaa mutaatiota AGXT2 geenissä (rs37369; P=1.4×10-40 ja rs16899974; P=1.5×10-38) sekä yhden SLC25A45 geenissä (rs34400381; P=2.5×10-10), jotka assosioituivat SDMA pitoisuuksiin. Lisäksi tutkimme tarkemmin AGXT2 geenilokusta useampien itsenäisten assosiaatiosignaalien havaitsemiseksi. Kaksi itsenäisesti SDMA tasoihin vaikuttavaa AGXT2-geenin yhden emäksen polymorfiaa assosioituivat myös sykkeen vaihteluun nuorilla aikuisilla. Uuden aminohappoavaihtavan rs16899974 (V498L) yhden emäksen polymorfian SDMA tasoja alentava alleeli oli lisäksi yhteydessä korkeampaan spektraalisen sykevaihtelun LF/HF-komponenttiin Laseri-tutkimuksessa (P=0.00047). Mikään nyt löydetyistä geneettisistä varianteista ei assosioitunut kokonaiskuolleisuuteen tai sydän- ja verisuonitautikuolleisuuteen LURIC-aineistossa.
Johtopäätökset:
AGXT2:lla on tärkeä rooli SDMA:n metaboliassa ihmisillä. AGXT2:lla saattaa olla
lisäksi aikaisemmin tunnistamaton rooli sydämen toimintaa säätelevän autonomisen hermoston
toiminnassa.
Published in European Heart Journal (October 24, 2013)
http://dx.doi.org/10.1093/eurheartj/eht447