Eturauhassyövän mitokondriaaliset haploryhmät suomalaisessa väestössä
TERO, NIINA (2008)
2008
Biokemia - Biochemistry
Lääketieteellinen tiedekunta - Faculty of Medicine
This publication is copyrighted. You may download, display and print it for Your own personal use. Commercial use is prohibited.
Hyväksymispäivämäärä
2008-05-14
Julkaisun pysyvä osoite on
https://urn.fi/urn:nbn:fi:uta-1-18174
https://urn.fi/urn:nbn:fi:uta-1-18174
Tiivistelmä
Tutkimuksen tausta ja tavoitteet: Eturauhassyöpä on maailmanlaajuisesti miesten yleisin syöpä. Huolimatta valtavista tutkimuspanostuksista edelleen on melko vähän tietoa syistä, jotka johtavat eturauhassyövän syntyyn, varsinkin perinnöllisen eturauhassyövän kohdalla. Tiedetään kuitenkin, että perimä on yksi selkeimmistä riskitekijöistä. Epidemiologissa tutkimuksissa on voitu osoittaa, että suvussa useat eturauhassyöpään sairastuneet nostavat selkeästi vielä terveiden miesten riskiä sairastua. Tämän tutkimuksen tarkoituksena oli selvittää mitokondriaalisen DNA:n ja erityisesti haploryhmien osuutta eturauhassyövän riskitekijänä. Toisin sanoen, voiko tietty haploryhmä altistaa kohonneelle eturauhassyöpäriskille suomalaisessa väestössä.
Tutkimusmenetelmät: Näytteinä käytettiin perhetaustaisia ja satunnaisesti valittuja eturauhassyöpään sairastuneita miehiä sekä kontrollipotilaina Suomen punaisen ristin verenluovuttajia. Kaikkien näytteiden mitokondriaalinen DNA sekvensoitiin ABI Prism 3100 DNA -sekvensaattorilla alueelle suunnitelluilla alukkeilla. Sekvensoinnista saadun datan avulla kullekin näytteelle määritettiin haploryhmät ja laskettiin kunkin haploryhmän assosiaatio eturauhassyöpään.
Tutkimustulokset: Tutkimuksessa saadun sekvensointidatan perusteella voidaan todeta, että tilastollisen merkitsevyyden kannalta syöpäpotilaiden kohdalla kontrolliryhmää yleisempiä olivat haploryhmät I ja TJ*, kun taas haploryhmä H oli yleisempi kontrolliryhmässä verrattuna syöpäpotilaiden näytteisiin. Sekvensoinnin myötä löytyi myös muutoskohta C7996A kaikista näytteistä, niin syöpä- kuin kontrolliryhmässä.
Johtopäätökset: Tässä työssä saadut tulokset osoittavat, että suomalaisväestössä eturauhassyövän riskitekijänä olisivat haploryhmät I ja TJ*, riippumatta siitä sairastuuko eturauhassyöpään perhetaustaisesti vai satunnaisesti. Haploryhmää H sen sijaan voidaan pitää potentiaalisena suojaavana tekijänä eturauhassyöpää vastaan, etenkin eturauhassyövässä perhetaustaisesti positiivisten miesten kohdalla. Uutta varianttia C7996A sytokromioksidaasi II-alayksikkössä voidaan pitää todennäköisesti normaalina sekvenssinä suomalaisten mitokondriaalisessa DNA:ssa.
Asiasanat: eturauhassyöpä, mitokondriaaliset haploryhmät, mitokondriaalinen DNA
Tutkimusmenetelmät: Näytteinä käytettiin perhetaustaisia ja satunnaisesti valittuja eturauhassyöpään sairastuneita miehiä sekä kontrollipotilaina Suomen punaisen ristin verenluovuttajia. Kaikkien näytteiden mitokondriaalinen DNA sekvensoitiin ABI Prism 3100 DNA -sekvensaattorilla alueelle suunnitelluilla alukkeilla. Sekvensoinnista saadun datan avulla kullekin näytteelle määritettiin haploryhmät ja laskettiin kunkin haploryhmän assosiaatio eturauhassyöpään.
Tutkimustulokset: Tutkimuksessa saadun sekvensointidatan perusteella voidaan todeta, että tilastollisen merkitsevyyden kannalta syöpäpotilaiden kohdalla kontrolliryhmää yleisempiä olivat haploryhmät I ja TJ*, kun taas haploryhmä H oli yleisempi kontrolliryhmässä verrattuna syöpäpotilaiden näytteisiin. Sekvensoinnin myötä löytyi myös muutoskohta C7996A kaikista näytteistä, niin syöpä- kuin kontrolliryhmässä.
Johtopäätökset: Tässä työssä saadut tulokset osoittavat, että suomalaisväestössä eturauhassyövän riskitekijänä olisivat haploryhmät I ja TJ*, riippumatta siitä sairastuuko eturauhassyöpään perhetaustaisesti vai satunnaisesti. Haploryhmää H sen sijaan voidaan pitää potentiaalisena suojaavana tekijänä eturauhassyöpää vastaan, etenkin eturauhassyövässä perhetaustaisesti positiivisten miesten kohdalla. Uutta varianttia C7996A sytokromioksidaasi II-alayksikkössä voidaan pitää todennäköisesti normaalina sekvenssinä suomalaisten mitokondriaalisessa DNA:ssa.
Asiasanat: eturauhassyöpä, mitokondriaaliset haploryhmät, mitokondriaalinen DNA