TMED5 ja DR1 virtsarakon levyepiteelisyövässä
TULISALMI, SINI (2013)
2013
Lääketiede - Medicine
Lääketieteen yksikkö - School of Medicine
This publication is copyrighted. You may download, display and print it for Your own personal use. Commercial use is prohibited.
Hyväksymispäivämäärä
2013-05-24
Julkaisun pysyvä osoite on
https://urn.fi/urn:nbn:fi:uta-1-23696
https://urn.fi/urn:nbn:fi:uta-1-23696
Tiivistelmä
Johdanto:Virtsarakon levyepiteelikarsinoomaa on alle 5 % kaikista virtsarakon syövistä. Suurin osa virtsarakon levyepiteelisyövistä on invasiivisia (T2-4) ja ne metastasoivat useimmiten virtsateihin tai eturauhaseen. Metafaasi-CGH – ja aCGH-tutkimuksissa on löydetty amplifikaatiot 1p22-lokuksessa tutkittaessa virtsarakon syöpiä. Kyseisessä lokuksessa sijaitsevat tutkittavat geenit DR1 ja TMED5. DR1:n koodaama proteiini alentaa transkriptiota estämällä transkriptiotekijöiden sitoutumisen TATA-binding proteiiniin. TMED5 koodaa p28-proteiinia, joka kuuluu Golgin laitteen proteiinierityksestä vastaavien proteiinien ryhmään.
Aineisto ja menetelmät:Tutkimuksessa käytin virtsarakon levyepiteelisyöpäsolulinjaa (ScaBER), niistä valmiiksi eristettyä RNA:ta sekä 20 ihmiskudoksesta eristettyä mRNA:ta. Vertasin qPCR:n avulla DR1-ekspressiota virtsarakossa 20 ihmiskudoksen DR1-ekspressioon amplifikaation merkityksen selvittämiseksi. Tutkin TMED5-geenin osuutta ScaBER-solulinjan kasvuun ja invaasiokykyyn estämällä TMED5:n ekspression tehokkaan siRNA:n avulla ja vertaamalla kyseisten solujen kasvua kontrolli-siRNA:lla transfektoitujen solujen kasvuun.
Tulokset ja pohdinta: DR1-ekspressio normaalissa virtsarakossa ei ole erityisen matala tai korkea. TMED5:llä ei ole tilastollisesti merkittävää vaikutusta syöpäsolujen kasvukykyyn (p = 0,46), joten se ei todennäköisesti ole osallinen virtsarakon levyepiteelisyövän patogeneesiin. DR1-geenin osalta tutkimusryhmässä jatketaan toiminnallisiin tutkimuksiin.
Avainsanat: virtsatiet, karsinooma, 1p22, amplifikaatio, patogeneesi
Aineisto ja menetelmät:Tutkimuksessa käytin virtsarakon levyepiteelisyöpäsolulinjaa (ScaBER), niistä valmiiksi eristettyä RNA:ta sekä 20 ihmiskudoksesta eristettyä mRNA:ta. Vertasin qPCR:n avulla DR1-ekspressiota virtsarakossa 20 ihmiskudoksen DR1-ekspressioon amplifikaation merkityksen selvittämiseksi. Tutkin TMED5-geenin osuutta ScaBER-solulinjan kasvuun ja invaasiokykyyn estämällä TMED5:n ekspression tehokkaan siRNA:n avulla ja vertaamalla kyseisten solujen kasvua kontrolli-siRNA:lla transfektoitujen solujen kasvuun.
Tulokset ja pohdinta: DR1-ekspressio normaalissa virtsarakossa ei ole erityisen matala tai korkea. TMED5:llä ei ole tilastollisesti merkittävää vaikutusta syöpäsolujen kasvukykyyn (p = 0,46), joten se ei todennäköisesti ole osallinen virtsarakon levyepiteelisyövän patogeneesiin. DR1-geenin osalta tutkimusryhmässä jatketaan toiminnallisiin tutkimuksiin.
Avainsanat: virtsatiet, karsinooma, 1p22, amplifikaatio, patogeneesi