SAP30L-VALKUAISEN TUMAJYVÄSVUOROVAIKUTUSTEN TUTKIMINEN

NIEMINEN, LAURA (2011)
 
Avaa tiedosto
Lataukset: 



NIEMINEN, LAURA
2011

Lääketiede - Medicine
Lääketieteen yksikkö - School of Medicine
This publication is copyrighted. You may download, display and print it for Your own personal use. Commercial use is prohibited.
Hyväksymispäivämäärä
2011-02-08
Näytä kaikki kuvailutiedot
Julkaisun pysyvä osoite on
https://urn.fi/urn:nbn:fi:uta-1-21624
Tiivistelmä
Syövissä geenien ilmentymisen säätely on usein häiriintynyt, mikä saa solut jakautumaan hallitsemattomasti. Transkriptio, eli DNA-ketjun mallin mukaan tapahtuva RNA-molekyylin rakentuminen, on tärkein tekijä, joka säätelee geenien ilmentymistä. Transkriptio on riippuvainen DNA:n pakkautumisasteesta, johon vaikuttaa DNA:n ympärillä olevien histoni-valkuaisten asetyloituminen. Asetyyliryhmien lisääminen histoneihin saa aikaan DNA:n rakenteen löystymisen ja aktiivisen transkription, kun taas niiden poistamisella on päinvastainen vaikutus. Histoneista asetyyliryhmiä poistavat entsyymit ovat nimeltään histonideasetylaaseja (HDAC), jotka muodostavat muiden valkuaisten kanssa toiminnallisia yksiköitä, repressorikomplekseja. Yksi näistä komplekseista on nimeltään Sin3A-korepressorikompleksi. SAP30L (Sin3A-associated protein 30-like) on eräs sen uusimmista jäsenistä. Se osallistuu geenien ilmentymisen säätelyyn geenien vaimentamisen kautta. RNA-helikaasit puolestaan ovat valkuaisia, jotka osallistuvat solujen kasvuun ja jakautumiseen.

Tutkimuksen tarkoituksena oli selvittää, sitoutuuko SAP30L RNA-helikaasi DDX56:n kanssa. Tämän selvittämiseksi käytettiin ns. pull-down-menetelmää, jossa solulysaatista "kalastetaan" valkuaisia GST-SAP30L-fuusioproteiinilla. Tulokset analysoitiin Western Blotting -menetelmällä.

SAP30L sitoutuu DDX56:n kanssa, mutta vuorovaikutus on heikko. Tämän vuorovaikutuksen todellinen merkitys vaatii jatkotutkimuksia.

Avainsanat: deasetylaatio, geenien ilmentyminen, HDAC
Kokoelmat