Hyppää sisältöön
    • Suomeksi
    • In English
Trepo
  • Suomeksi
  • In English
  • Kirjaudu
Näytä viite 
  •   Trepo etusivu
  • Trepo
  • Artikkelit
  • Näytä viite
  •   Trepo etusivu
  • Trepo
  • Artikkelit
  • Näytä viite
JavaScript is disabled for your browser. Some features of this site may not work without it.

PseudoGeneQuest Service for identification of different pseudogene types in the human genome

Ortutay, Csaba; Vihinen, Mauno (2008)

 
Tweet refworks
 
Avaa tiedosto
pseudoGeneQuest_2008.pdf (424.9Kt)
Lataukset: 



Ortutay, Csaba
Vihinen, Mauno
2008

BMC Bioinformatic 9
299
This publication is copyrighted. You may download, display and print it for Your own personal use. Commercial use is prohibited.
doi:10.1186/1471-2105-9-299
Näytä kaikki kuvailutiedot
Julkaisun pysyvä osoite on
http://urn.fi/urn:nbn:uta-3-572

Kuvaus

BioMed Central Open access
Tiivistelmä
Background

Pseudogenes, nonfunctional copies of genes, evolve fast due the lack of evolutionary pressures and thus appear in several different forms. PseudoGeneQuest is an online tool to search the human genome for a given query sequence and to identify different types of pseudogenes as well as novel genes and gene fragments.

Description

The service can detect pseudogenes, that have arisen either by retrotransposition or segmental genome duplication, many of which are not listed in the public pseudogene databases. The service has a user-friendly web interface and uses a powerful computer cluster in order to perform parallel searches and provide relatively fast runtimes despite exhaustive database searches and analyses.

Conclusion

PseudoGeneQuest is a versatile tool for detecting novel pseudogene candidates from the human genome. The service searches human genome sequences for five types of pseudogenes and provides an output that allows easy further analysis of observations. In addition to the result file the system provides visualization of the results linked to Ensembl Genome Browser. PseudoGeneQuest service is freely available.
Kokoelmat
  • Artikkelit [6066]
Kalevantie 5
PL 617
33014 Tampereen yliopisto
oa[@]tuni.fi | Yhteydenotto | Tietosuoja | Saavutettavuusseloste
 

 

Selaa kokoelmaa

TekijätNimekkeetTiedekunta (2019 -)Tiedekunta (- 2018)Tutkinto-ohjelmat ja opintosuunnatAvainsanatJulkaisuajatKokoelmat

Omat tiedot

Kirjaudu sisäänRekisteröidy
Kalevantie 5
PL 617
33014 Tampereen yliopisto
oa[@]tuni.fi | Yhteydenotto | Tietosuoja | Saavutettavuusseloste