Lehmänmaidon solutasoon vaikuttavien tekijöiden tutkiminen lineaarisella sekamallilla
Kaidesoja, Saana (2025)
2025
Matematiikan ja tilastollisen data-analyysin kandidaattiohjelma - Bachelor's Programme in Mathematics and Statistical Data Analysis
Informaatioteknologian ja viestinnän tiedekunta - Faculty of Information Technology and Communication Sciences
This publication is copyrighted. You may download, display and print it for Your own personal use. Commercial use is prohibited.
Hyväksymispäivämäärä
2025-06-02
Julkaisun pysyvä osoite on
https://urn.fi/URN:NBN:fi:tuni-202505316465
https://urn.fi/URN:NBN:fi:tuni-202505316465
Tiivistelmä
Lehmänmaidon somaattisten solujen määrään vaikuttavat monet eri tekijät. Maidon solutasoa on tärkeää mitata ja seurata mahdollisten utaretulehdusten varalta. Utaretu- lehdukset ovat yksi maitotilojen suurimmista kulueristä, joten niiden ennaltaehkäisy on hyvin tärkeää. Somaattisten solujen määrä vaikuttaa myös maidosta maksettavaan hintaan.
Tässä tutkielmassa luodaan lineaarinen sekamalli R-ohjelmiston lmer-funktion avulla. Aineiston muuttujat jaetaan kiinteisiin vaikutuksiin ja satunnaisvaikutuksiin. Mallin tavoitteena on löytää solutasoon vaikuttavat tekijät. Mallin luomisessa hyö- dynnetään REML-menetelmää. Mallista lasketaan studentoituja jäännöksiä, joiden tarkoituksena on löytää solutason poikkeavia havaintoja. Aineistona käytetään Ren- gon maitotilan lehmille tehtyjä koelypsymittauksia.
Mallin avulla havaittiin, että lehmän iällä on vaikutusta maidon solutasoon. Holstein-rotuisten lehmien solutaso oli keskimäärin korkeampi kuin ayrshire-rotuisten. Mallin mukaan yksilöiden välillä solutasossa oli voimakasta vaihtelua. Keskilämpö- tilalla ja maidon määrällä ei ollut selvää vaikutusta solutasoon. Studentoitujen jään- nösten avulla aineistosta löydettiin 15 poikkeavaa havaintoa, joista kuusi havaittiin samalla yksilöllä. Luotua sekamallia tulisi vielä kehittää tai aineistoon tulisi kerätä lisää havaintoja, jotta tilastollisesti solutasoon vaikuttavia tekijöitä voitaisiin mallin avulla tunnistaa enemmän.
Tässä tutkielmassa luodaan lineaarinen sekamalli R-ohjelmiston lmer-funktion avulla. Aineiston muuttujat jaetaan kiinteisiin vaikutuksiin ja satunnaisvaikutuksiin. Mallin tavoitteena on löytää solutasoon vaikuttavat tekijät. Mallin luomisessa hyö- dynnetään REML-menetelmää. Mallista lasketaan studentoituja jäännöksiä, joiden tarkoituksena on löytää solutason poikkeavia havaintoja. Aineistona käytetään Ren- gon maitotilan lehmille tehtyjä koelypsymittauksia.
Mallin avulla havaittiin, että lehmän iällä on vaikutusta maidon solutasoon. Holstein-rotuisten lehmien solutaso oli keskimäärin korkeampi kuin ayrshire-rotuisten. Mallin mukaan yksilöiden välillä solutasossa oli voimakasta vaihtelua. Keskilämpö- tilalla ja maidon määrällä ei ollut selvää vaikutusta solutasoon. Studentoitujen jään- nösten avulla aineistosta löydettiin 15 poikkeavaa havaintoa, joista kuusi havaittiin samalla yksilöllä. Luotua sekamallia tulisi vielä kehittää tai aineistoon tulisi kerätä lisää havaintoja, jotta tilastollisesti solutasoon vaikuttavia tekijöitä voitaisiin mallin avulla tunnistaa enemmän.
Kokoelmat
- Kandidaatintutkielmat [9897]