Human Prostate Tissue MicroRNAs and Their Predicted Target Pathways Linked to Prostate Cancer Risk Factors
Enwald, Max (2022)
2022
Lääketieteen lisensiaatin tutkinto-ohjelma - Licentiate's Programme in Medicine
Lääketieteen ja terveysteknologian tiedekunta - Faculty of Medicine and Health Technology
This publication is copyrighted. You may download, display and print it for Your own personal use. Commercial use is prohibited.
Hyväksymispäivämäärä
2022-01-24
Julkaisun pysyvä osoite on
https://urn.fi/URN:NBN:fi:tuni-202111308821
https://urn.fi/URN:NBN:fi:tuni-202111308821
Tiivistelmä
MikroRNA:t (miRNA:t) ovat molekyylejä, jotka osallistuvat geenien transkription jälkeiseen säätelyyn estämällä lähetti-RNA:n toimintaa. Niillä on osoitettu olevan tärkeä rooli eturauhassyövän kehittymisessä, etenemisessä ja metastasoinnissa. Tämän tutkimuksen tarkoituksena on etsiä yhteyksiä eturauhassyöpäpotilaiden eturauhasen kudosnäytteistä tehdyn miRNA-ilmentymisprofiilin ja valikoitujen eturauhassyöpään liittyvien tekijöiden välillä, sekä selvittää näiden miRNA:iden ennustetut kohteena olevat aineenvaihduntareitit.
Eturauhasen kudosnäytteet saatiin eturauhasen poistoleikkauksen yhteydessä potilailta, jotka osallistuivat tutkimukseen, jossa selvitettiin ennen operaatiota annettavan atorvastatiini-kuurin vaikutusta seerumin prostataspesifisen antigeenin pitoisuuteen sekä eturauhasen Ki-67-proteiinin ilmentymiseen. Kudosnäytteiden miRNA-ilmentymisprofiili määritettiin käyttäen OpenArray® miRNA-paneelia. Tutkittujen tekijöiden kanssa merkitsevästi korreloivien miRNA:iden ennustetuille geenikohteille tehtiin aineenvaihduntareittien rikastumisanalyysi.
Kahdeksan miRNA:n havaittiin korreloivan merkitsevästi tutkittujen tekijöiden kanssa myös monitestauksen vuoksi tehdyn Bonferroni-korjauksen jälkeen. MiR-485-3p korreloi seerumin HDLkolesterolitasojen kanssa. MiR-34c-5p korreloi prostataspesifisen antigeenin seerumipitoisuuden muutoksen kanssa ja miR-138-3p kokonaiskolesterolin muutoksen kanssa atorvastatiinia saaneiden tutkimushenkilöiden joukossa. Plaseboryhmässä sekä miR-576-3p, että miR-550-3p korreloivat seerumin HDL-kolesterolin kanssa ja lisäksi miR-627 korreloi seerumin prostataspesifisen antigeenin kanssa. MiR-576-3p:tä lukuun ottamatta kaikki edellä mainitut korrelaatiot pysyivät merkitsevinä myös sekoittavilla tekijöillä säädetyssä regressioanalyysissä. Aineenvaihduntareittien rikastumisanalyyseissä nämä kahdeksan miRNA:ta olivat merkitsevästi yhteydessä useisiin eturauhassyövän kannalta merkittäviin aineenvaihduntareitteihin. Korkeaannoksinen atorvastatiinihoito ennen eturauhasen poistoleikkausta ei vaikuttanut eturauhaskudoksen miRNA-ilmentymisprofiiliin.
Tämä tutkimus laajentaa tietämystämme eturauhasen miRNA:iden ilmentymisestä ja niihin liittyvistä aineenvaihduntareiteistä, jotka voisivat yhdistää eturauhassyövän riskitekijöitä taudin syntyyn. Tästä voi olla hyötyä tulevien eturauhassyövän hoitomenetelmien kehittämisessä.
Eturauhasen kudosnäytteet saatiin eturauhasen poistoleikkauksen yhteydessä potilailta, jotka osallistuivat tutkimukseen, jossa selvitettiin ennen operaatiota annettavan atorvastatiini-kuurin vaikutusta seerumin prostataspesifisen antigeenin pitoisuuteen sekä eturauhasen Ki-67-proteiinin ilmentymiseen. Kudosnäytteiden miRNA-ilmentymisprofiili määritettiin käyttäen OpenArray® miRNA-paneelia. Tutkittujen tekijöiden kanssa merkitsevästi korreloivien miRNA:iden ennustetuille geenikohteille tehtiin aineenvaihduntareittien rikastumisanalyysi.
Kahdeksan miRNA:n havaittiin korreloivan merkitsevästi tutkittujen tekijöiden kanssa myös monitestauksen vuoksi tehdyn Bonferroni-korjauksen jälkeen. MiR-485-3p korreloi seerumin HDLkolesterolitasojen kanssa. MiR-34c-5p korreloi prostataspesifisen antigeenin seerumipitoisuuden muutoksen kanssa ja miR-138-3p kokonaiskolesterolin muutoksen kanssa atorvastatiinia saaneiden tutkimushenkilöiden joukossa. Plaseboryhmässä sekä miR-576-3p, että miR-550-3p korreloivat seerumin HDL-kolesterolin kanssa ja lisäksi miR-627 korreloi seerumin prostataspesifisen antigeenin kanssa. MiR-576-3p:tä lukuun ottamatta kaikki edellä mainitut korrelaatiot pysyivät merkitsevinä myös sekoittavilla tekijöillä säädetyssä regressioanalyysissä. Aineenvaihduntareittien rikastumisanalyyseissä nämä kahdeksan miRNA:ta olivat merkitsevästi yhteydessä useisiin eturauhassyövän kannalta merkittäviin aineenvaihduntareitteihin. Korkeaannoksinen atorvastatiinihoito ennen eturauhasen poistoleikkausta ei vaikuttanut eturauhaskudoksen miRNA-ilmentymisprofiiliin.
Tämä tutkimus laajentaa tietämystämme eturauhasen miRNA:iden ilmentymisestä ja niihin liittyvistä aineenvaihduntareiteistä, jotka voisivat yhdistää eturauhassyövän riskitekijöitä taudin syntyyn. Tästä voi olla hyötyä tulevien eturauhassyövän hoitomenetelmien kehittämisessä.